王锡爵的奏疏可谓是极为尖刻的，王锡爵认为现在的科道既没有监察户部的想法，更没有监察户部的能力，他们只会侈谈国家，而不能解决实际问题。
所以说，总结王锡爵的奏疏，就是户部的司官吏员不是东西，吏部的堂官们有意因循苟且，户科和都察院御史们是无能且无为，总之就是四个字，大明要完。
朱载坖听完了之后，笑着说道：“王锡爵此本，甚有意思，下内阁，令各官上疏自辩。”
王锡爵的奏疏直接在朝堂引起了轩然大波，涉事的官员们自然是纷纷上疏自辩，户部尚书马森直接上疏请辞，尽管朱载坖再三挽留，但是马森去意已决，不愿再担任户部尚书，马森认为自己确实是年事已高，没有精力再处理户部这么繁杂的事情，请求朱载坖另选贤能。
对于王锡爵的奏疏，马森则是认为切中时弊，确实将户部现在存在的问题给说明白了，但是这些事情并不是一时半会就能形成，很多东西都是年深日久就形成的。
就如同部、科之间的关系，并非是一开始就是这样的，在大明刚刚建国的时候，六部的地位是极高的，但是随着时间的推移，科权越来越重，部权越来越轻，在强势的科道官面前，不仅仅是户部，六部几乎毫无立场。对于六科对以六部为首的内外诸司章奏的稽查、注销流于形式的原因，马森的看法和王锡爵是一样的，因为许多意见建议本就是给事中提出来的，六科又怎么去否决自己的建议呢？.M
哪怕明明是馊主意，六科都会按着六部的头将之执行下去。对于这种情况，并非一时一世而形成的，而是长久以来的形成的，想要纠正，也不是一时半会就能行的。
马森认为王锡爵的奏疏很有见地，一语道破了现在六科和六部的关系，虽然自己无法再为朱载坖效力了，但是希望朱载坖能够采纳王锡爵的相关建议，制定合理的办法，规范科权与部权。
朱载坖在收到马森的请辞奏疏之后，赶紧下旨挽留，但是马森还是坚持上疏求去，朱载坖于是召见马森，请这位老臣到文华殿面谈。
马森到了之后，朱载坖说道：“大司农，眼下国事方殷，卿岂可遽离？”
马森笑着说道：“陛下，老臣才具不足，实难胜任大司农之职，还请陛下另择贤能。”
朱载坖说道：“难道是因为王锡爵的奏疏？”
马森摇摇头说道：“陛下言重了，老臣早有去意，与王太仓无关也。”朱载坖向马森询问他对于科权、部权的看法。马森并没有正面回答朱载坖，而是讲了一些嘉靖年间的旧事。
马森说当年严嵩当首辅的时候，曾经向嘉靖上疏称：“言官论事皆无深虑，偶有臆见，任意陈奏。该部不审可否，畏奉言官，一概题覆准行。”
而嘉靖的御批也很有意思，嘉靖御批道：“天下大政属之六部，言官意见或有异同，部臣当执可否以为行止。尔等何每事辄与题覆，以致方行遽改，甚非政体。”
这君臣两位对于言官都不是很买账，严嵩自不待言，和言官几乎是势成水火，嘉靖也一向不待见他们。